Aquatim a fost înfiinţată ca regie autonomă la 1 martie 1991, preluând responsabilităţile structurilor administrative locale care gestionau serviciile de apă şi de canalizare. În anul 2007, statului organizației se schimbă, din regie în societate comercială, iar serviciile sunt extinse în Deta şi Jimbolia. Compania devine operator regional pe aria județului Timiș în 2010.
Istoria sistemelor moderne de apă și canalizare din Timișoara stă sub semnul inovației și sustenabilității. Prima staţie de tratare a apei uzate de pe teritoriul României a fost pusă în funcţiune la Timişoara, în 26 octombrie 1912, iar prima uzină de apă a oraşului la 1 iunie 1914. Tot în 1914 s-a înfiinţat ACOT, Întreprinderea de apă-canal a oraşului Timişoara, prima formă de organizare a serviciilor publice din ţară. O personalitate remarcabilă a vremii, inginerul Stan Vidrighin, a fost unul dintre vizionarii care au adus Timișoara în rândul orașelor moderne ale Europei la începutul secolului XX. În paginile volumului editat de Aquatim, Alimentarea cu apă a Timișoarei. Istorie, prezent și perspective se găsesc mai multe informații detaliate despre apa și viața „cetății” și cum a dus mai departe Aquatim moștenirea lăsată de Stan Vidrighin.