În anul 1872, se naște Societatea de Istorie și Arheologie a Ungariei de Sud, iar primul său președinte este Zsigmond Ormós (1813-1894), care la acea vreme era și Prefectul județului Timiș.
În 1877, muzeul își deschide porțile pentru public. Expozițiile au avut loc în clădirea Wellauer (astăzi Biblioteca Academiei Române) și au prezentat artefacte descoperite sau achiziționate de către cercetătorii Societății de Istorie și Arheologie.
În 1896, Muzeul Banatului expune unele dintre comorile sale la Expoziția din Budapesta, obținând o medalie de bronz și o Diplomă de Recunoștință.
Perioada 1914-1918 aduce grave dificultăți financiare muzeului, din cauza izbucnirii Primului Război Mondial. Cu toate acestea, membrii Societății de Istorie și Arheologie găsesc resurse pentru a sprijini eforturile de război ale Imperiului cu suma de 10.000 Rr. În ciuda multor probleme, muzeul reușește să-și extindă colecțiile. Datorită inspirației curatorului principal Berkeszi István, muzeul începe să colecteze obiecte de război și reușește să deschidă prima expoziție dedicată Marelui Război în anul 1917.
Între anii 1919 și 1948, după ce provincia Banat devine parte a Regatului României, Muzeul Banatului se confruntă cu lipsa de spațiu și probleme administrative. Este Emanuil Ungureanu cel care convinge Consiliul Local să se implice în gestionarea muzeului. În 1928, cunoscutul intelectual bănățean Ioachim Miloia devine director al muzeului. Până la moartea sa prematură în 1940, acesta încurajează numeroase studii arheologice și etnografice în regiunea Banatului. În timpul celui de-Al Doilea Război Mondial, întreaga colecție a muzeului trebuie relocată pentru a fi în siguranță.
Perioada 1948-1989 aduce o reorganizare serioasă pentru muzeul afectat de război. În 1948, Marius Moga devine director al instituției. În același an, muzeul se mută în Castelul Huniade. Pentru prima dată în istoria sa, muzeul dispune de o clădire demnă de prestigiul său. M. Moga contribuie la renașterea muzeului, reorganizează rapid colecțiile și relansează cercetările arheologice în regiunea Banatului. Tot el se implică în aducerea de cercetători tineri și entuziaști, precum Florin Medelet sau Ortansa Radu. În timpul Revoluției din 1989, colecțiile sunt apărate curajos de către angajații care petrec nopți păzind comorile muzeului.
De asemenea, este important de menționat că, în prezent, din cauza lucrărilor de restaurare, administrația Muzeului și expozițiile temporare sunt găzduite de Bastionul Theresia, situat pe strada Martin Luther, numărul 4. Acest loc emblematic oferă un cadru pitoresc și impresionant pentru explorarea colecțiilor deosebite și evenimentelor culturale organizate de Muzeul Național al Banatului.